Le protocole 2007-2009 prévoyait la refonte de l’IFR, devenue depuis PFR. Le report de la mise en oeuvre de la part fonctionnelle de cette indemnité a constitué un manque à gagner manifeste pour les adjoints et assistants d’administration, qui court depuis le 1er juillet 2009. En revanche, la NBI que devait remplacer la part fonctionnelle de la PFR a bel et bien disparu des Avis de Vacances d’Emploi, et donc des salaires versés aux agents nouvellement affectés sur des postes auparavant bonifiés.